안개속의 진실을 찾아서...

WatCut : Translation, 제한효소 그리고 Silent mutation을 동시에 볼수 있는 프로그램 by 새벽안개

2012/05/12 00:55
생물정보학
hosunson.egloos.com/3324160
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사용기기: 웹브라우저
프로그램: WatCut (일명 워털루-컷)
제공자: by Michael Palmer, University of Waterloo, Ontario, Canada
Version: June 19, 2007
링크 : http://watcut.uwaterloo.ca/watcut/watcut/template.php?act=restriction_new

클로닝용 유전자 서열분석 프로그램으로 주요기능은 제한효소와 ORF 분석인데 절제된 깔끔한 인터페이스가 돋보인다.
이 프로그램은 그래픽, 표, 텍스트의 3가지 디스플레이 모드를 제공하는데 정리된 깔끔한 제한효소 표(Talbe)과
다수의 ORF translation과 동시에 제한효소 사이트를 단정하게 보여주는 텍스트 디스플레이가 훌륭하다.
사용자가 원하는 제한효소만을 골라서 사용하는
"Select_enzymes" 의 "Edit or create a custom enzyme set" 기능이 맘에 든다.

태그 : 제한효소, Translation, ORF, silent_mutation, WatCut, 생물정보학

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NEB 제한효소 검색 앱 by 새벽안개

2012/05/12 00:31
생물정보학
hosunson.egloos.com/3324148
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사용기기: iOS (아이폰, 아이팟, 아이패드)
프로그램: NEB Tools
Version 1.3.2
링크 : http://itunes.apple.com/us/app/neb-tools/id350346827?mt=8&ign-mpt=uo%3D6

생물학 실험실에서 제한효소 분석에 대한 Reference 정보를 확인하는 사전으로 유용하다.
두가지 제한효소를 동시에 처리할때 버퍼 조건을 검색하는 Double digest 와
제한효소의 이름검색, 인식서열 검색 또한 유용하다.

컴퓨터로 유전자 설계등의 작업하면서 또 다른 창에서 제한효소 사전을 볼수 있어서 편리하다.

태그 : NEB, 제한효소

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Stay Hungry, Stay Foolish! by 새벽안개

2012/04/26 13:53
[펌]명문장
hosunson.egloos.com/3158784
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Stay Hungry, Stay Foolish!
늘 배고픈 마음으로 살아라,
늘 바보같은 마음으로 살아라!

태그 : 스티브잡스

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도대체 스마트 란 무엇인가? by 새벽안개

2012/01/14 23:41
잡담
hosunson.egloos.com/3284746
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최근 스마트란 말은 도처에서 찾아볼수 있다. 스마트폰, 스마트TV, 스마트 냉장고, 연아가 광고하는 스마트 에어콘, 스마트 청소기 등 다양하다. 그런데 정작 스마트컴퓨터 라는 말은 거의 안쓰는것 같다. 그런데 도대체 이런 가전제품이 스마트 하다는 것은 어떤 특성을 말하는 것일까?

사전에 나오는 'smart' 는 clever, bright, intelligent, 이라니 대략 똑똑하고 영리하고 명석한 것을 말한다.

한국말에서 스마트의 반대말은 멍청하고 둔하고 바보같은 것을 말할 것이다.

나는 사람이 아닌 전자제품이 똑똑할수 있다는 것을 믿지 않는 편이다. 내가 처음 컴퓨터를 접한 것은 1986년 한국산 애플II 였다.

그때 기대하기를 컴퓨터만 있으면 뭐든지 할수 있을줄 알았다. 하지만 현실은 시키는 것도 정확하게 시키지 않으면 못하는 멍청한 놈이었다. 그리고 업무를 위해 수많은 윈도우 PC를 써 왔지만 컴퓨터가 스마트 할거라는 기대는 버린지 오래였다.

그러나 일년전부터 아이폰을 쓰게되면서 스마트폰에서 '스마트'라는 말이 빈말이 아님을 알았다.

그럼 스마트폰은 왜 스마트 한 것일까?

첫번째는 다양하고 예민한 센서들이 예민하고 영리한 기기를 가능하게 해 준다.

일반적으로 1) 시간과 날짜 2) GPS좌표 3) 나침반 4) 중력센서 5) 회전가속도센서 6)카메라센서 7)소리센서 8)터치스크린 9)밧데리 센서 10) 3G, WiFi, 블루투스 전파센서 가 기본장착된다. 온도센서 빼고 웬만한건 다 있다는 느낌이다.

두번째는 소프트웨어적인 정보의 통합이다. 화면 디스플레이 회전방향과 카메라 사진의 방향을 결정하는데 중력센서 데이타를 적용하고, 지도 프로그램은 목적지를 음성인식하고, 현재위치와 나침반 방위 그리고 지도상의 도로혼잡상황을 인지하여 사용자에게 알려준다.

세번째는 사용자의 반복적 요구를 인식하여 저절로 재구조화 하는 것이다. 예를 들면 자주 전화를 하는 상대방을 북마크의 상위에 올려 놓는다든가. 네비게이션에서 자주가는 곳을 쉽게 찾을수 있게 하는 것이다. 이런 기능 대부분은 아직 수동설정이지만 사용자 편리성이라는 측면에서 볼때 대단히 중요하다. 스마트의 궁극적 목표는 사용자가 간단하게 이들 기기를 쓸수 있게 하는 것이기 때문이다. 스마트 청소기라면 자기 청소구역의 특성을 잘 파악하고 어디에 먼지가 많은지를 기본적으로 알고 있어야 하는거다.

네번째는 방대한 참고정보를 이용하는 능력이다. 구글지도나 네이버 다음지도의 경우 휴대폰에 대용량의 방대한 지리정보를 저장하고 있지 않아도 그때 그때 서버에서 제공되는 지리정보로 상세한 지도와 영상정보를 통합해서 사용하게 해 준다. 간선도로의 정체상황, 일기예보, 버스도착 예정시간등 적절한 인터넷 서버의 연결능력과 적절한 앱이 없다면 스마트 폰이 똑똑해 질수 없다.

다섯째는 컨텍스트의 이해능력인데.... 이건 아직 초보수분에 머물고 있는것 같다.

그렇다면 이런 특징들을 수치화 할수도 있지 않을까? '얼마나' 예민하고 똑똑한지....

1 센서 점수 :

2 소프트웨어통합 점수 :

3 개인적응 점수:

4 참고정보연결 점수:

앞으로 우리의 생활을 자연스럽게 통합해 줄 똑똑한 기기는 어떤것이 나올지 기대된다.

태그 : 스마트기기

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